疼痛是子宫内膜异位症的最常见主诉。表现为周期性的月经前后及行经时的疼痛，开始时往往持续1—2天，以后逐渐延长且疼痛进行性加重，需要镇痛治疗，可伴有出冷汗、恶心呕吐、里急后重等症状。

        疼痛的程度与病灶的大小无直接关系，但病灶的部位却与疼痛的表现有关，腹膜上的病灶尤其阔韧带后叶外侧常表现为下腹进行性疼痛，宫骶韧带上病灶易引起性交痛，直肠子宫陷凹及盆腔腹膜与直肠相连接病灶易致经期排便次数增多，腹痛及腹泻等，卵巢的病灶多表现为囊肿，其内含有陈旧性血液，稠而呈褐色似巧克力液，平时可无疼痛表现，但假如发生囊壁破裂，内容物流出，可引起急性腹痛，出现腹膜炎征象，重者可发生休克，若流出量少而反复发生，将导致四面纤维化粘连而固定。

        出血是内膜异位症的另一常见主诉。子宫肌腺病表现为月经量增多，经期延长等，且呈进行性加重趋势;非子宫部位的内膜异位病灶可引起异常出血，如膀胱输尿管内病灶可引起经期血尿，或输尿管受阻而出现肾盂积血、积水等。无论有无症状，据报道，生育年龄妇女中约有40—50的不孕症患者与子宫内膜异位症有关，子宫内膜异位症导致生殖器官的粘连和阻塞、排卵异常及盆腔内免疫微环境异常等均可引起不孕，故对不孕症患者要重点许多方询问和检查有无子宫内膜异位症存在。